Não terá pousado aí um pano com algum tipo de químico?
Aconteceu-me uma coisa parecida num lava-loiças que tenho na garagem. Estive a limpar umas manchas de ferrugem no pavimento da garagem com um produto químico, depois deixei o pano com que estive a fazer essa limpeza no lava-loiças, sem passar logo por água, e ficou logo com manchas que já não saem...